卫生检验与检疫系（简称卫检系）由公共卫生学院原卫生化学教研室与预防教研室合并而成，2021年更名为卫生检验与检疫系。卫生检验与检疫学系集中了一批优秀的中青年骨干教师，在相关学科的教学、科学研究和科技服务等方面均有较强的优势。目前，卫检系共有教师13人，其中教授3人，副教授5人，讲师5人。13人中有博士生导师2人，硕士研究生导师7人，具有博士学位者10人，硕士学历3人。

目前，本学系承担的教学工作主要包括：预防医学专业《卫生化学》课程、医学检验专业《分析化学》课程以及全校所有医学类专业的《预防医学》课程，同时还承担公共卫生学院相关研究生的理论课程和实验教学。从2023年起，学系依托公共卫生学院公共卫生与预防医学一级学科博士点，招收卫生检验方向学术型博士。

卫生检验与检疫学系具备较好的科学研究基础，在卫生检验新技术与新方法的开发及应用、食品/环境有害因素识别与风险评价、健康危害生物标志物检测与评价、卫生检验与疾病防控等方面形成较好的特色和优势。近年来，本学科承担国家自然科学基金和省部级科技计划10余项，横向项目7项，发表SCI论文50余篇，授权发明专利10余项。

卫生检验与检疫学系将以“学科融合，创新发展”为理念，以学科建设和高质量人才培养为重点，加大科研创新和教学改革力度，为多出科研成果、培养高素质人才，并为南通大学公共卫生学院的发展做出贡献。